Lex continua a sottoporsi di sua volontà ad un esperimento per recuperare la memoria al fine di scoprire cosa sia successo nelle settimane che non si ricorda più dopo che suo padre l’aveva sottoposto all’elettroshock per far sì che il figlio dimenticasse che è stato lui a uccidere i suoi genitori. Lex spera, così facendo, di recuperare delle informazioni da dare all'FBI contro suo padre.
In seguito al procedimento, Lex inizia a ricordare frammenti della sua infanzia scoprendo così che il vero responsabile della morte del fratellino Julian non è lui ma la madre. Quest’ultima lo aveva soffocato infatti nella culla per impedire che crescesse combattendo con Lex per avere l’affetto di Lionel. Lo aveva ucciso, nelle sue intenzioni, per non farlo soffrire in seguito. Lungo tutto questi anni, Lionel aveva sempre creduto che il responsabile della sua morte fosse Lex: quando il figlio gli rivela che si ricorda tutto e che aveva rimosso questi ricordi perché non voleva credere a quello che aveva fatto la madre ed inoltre voleva proteggerla dall’ira di Lionel, quest’ultimo gli dice che, se lo avesse saputo prima, forse le cose tra loro sarebbero andate in maniera diversa.
Clark, nel frattempo, contatta Lionel per impedire che Lex continui le sedute di recupero della memoria perché vuole sia proteggere l’amico da eventuali danni cerebrali sia impedire che si ricordi il suo segreto. Clark viene però tradito da Lionel che lo consegna agli scienziati come cavia in modo che questi smettano di operare su Lex.
Mentre Clark è immerso nel fluido alla kryptonite per recuperare le sue prime memorie, si ricorda il momento in cui Jor-El e la madre Lara l’hanno posizionato nella navicella per salvarlo e capisce che la madre biologica non è affatto un mostro come credeva visto il comportamento di Jor-El.
Infine, Lex porta in salvo Clark dalla singolare seduta di recupero della memoria.