Dexter, il prozio di Lana, condannato per l'omicidio di sua moglie Louise quaranta anni prima, mostra alla giovane nipote la foto di colui che lui pensa sia il vero responsabile dell'assassinio, e Lana è shockata quando si accorge che il presunto omicida assomiglia a Clark. L'uomo è in realtà Jor-El, mandato dalla Terra per fare esperienza da suo padre. Le indagini di Clark lo guidano fino ad un medaglione che gli permette di avere delle visioni su un pezzo del passato di Jor-El e la vita che aveva iniziato molto prima che lui arrivasse sulla Terra. Clark vede così Jor-El (Joe sulla Terra) e la sua relazione con la zia di Lana, Louise, in una trasposizione anni '60 della storia tra Clark e Lana. Grazie a questi flashback Clark riesce a scagionare il prozio di Lana perché capisce che il vero colpevole della morte di Louise è in realtà lo sceriffo attuale di Smallville, innamorato della donna, il quale voleva in realtà uccidere Joe e far ricadere la colpa dell’omicidio su Dexter per poi avere la strada libera con Louise. Clark scopre inoltre che le persone che aiutarono Jor-El a fuggire furono i genitori di Jonathan e quindi capisce che non è un caso che proprio Jonathan e Martha lo abbiano trovato nel campo di grano.
Nel frattempo, Lex scopre che l’incendio in cui morirono i suoi nonni fu di origine dolosa ed è quindi determinato a scoprire i colpevoli dell’accaduto.

Lana: Devi pur venire da qualche parte. Non è che sei caduto dal cielo.

Lex: Perché dovrei pagare per le colpe di mio padre?

Jor-EL/Joe: Perché è il mio destino. Non posso cambiarlo.

Jor-El/Joe: Da dove vengo abbiamo colori che non hai mai visto. Le nostre lune sono così vicine che riempiono la metà del cielo. Abbiamo tramonti che durano ore